بر اساس ماده 3 این طرح،‌ ماده 41 قانون آیین‌نامه داخلی مجلس به این شکل اصلاح می‌شود که هیأت رئیسه پس از تعیین امتیاز و رتبه‌بندی، نسبت به تکثیر و توزیع گزارش آن اقدام می‌کند. نمایندگان معترض می‌توانند ظرف 48 ساعت پس از توزیع گزارش، اعتراض خود را نسبت به امتیازها به هیأت رئیسه تقدیم کنند تا هیأتی مشترک متشکل از هیأت رئیسه مجلس و روسای شعب با دعوت از نماینده معترض به امتیاز خود، ظرف 48 ساعت پس از انقضا مهلت فوق، به اعتراضات رسیدگی و اعلام نظر نمایند.

پس از اتمام این مراحل هیأت رئیسه نسبت به تعیین و اعلام فهرست اعضای کمیسیون‌های تخصصی بر مبنای امتیازات هر فرد اقدام می‌کند. همچنین بر اساس تبصره 1 این ماده، پس از اعلام اسامی اعضای کمیسیون‌های تخصصی، در صورتی که هر یک از نمایندگان به کمیسیون انتخاب شده اعتراض داشته باشند می‌توانند ظرف مدت 24 ساعت اعتراض خود را به صورت مکتوب به هیأت رئیسه مجلس تقدیم کنند تا هیأت مشترک فوق‌الذکر با استماع نظرات معترضان و بررسی اعتراض‌های واصله نسبت به تعیین نهایی اعضای کمیسیون‌های تخصصی تا 48 ساعت پس از انقضا مهلت اعتراض اقدام کند.

 ماده 4 این طرح که بر اساس آن تعداد اعضای کمیسیون‌های فرهنگی و حقوقی 13 نفر تعیین شده و تعداد اعضای کمیسیون انرژی برای دوره جاری 24 نفر تعیین شده بود، با موافقت نمایندگان مواجه نشد و به کمیسیون تدوین آیین‌نامه داخلی مجلس ارجاع شد.